Mokslas

 

Mokslinės produkcijos sąrašas Scopus duomenų bazėje – spauskite čia.

Pažymėtinos mokslinės publikacijos:

  1. A. Gelzinis, L. Valkunas, Analytical derivation of equilibrium state for open quantum system, J. Chem. Phys. 152, 051103, 2020.
    Šiame darbe mes išvedėme analitinę išraišką pusiausvyram redukuotam sistemos tankio operatoriui. Mūsų išraiškos galiojimo ribos yra gerokai platesnės nei skaičiavimų, paremtų įprasta trikdžių teorija. Mes įvedėme efektinę rezonansinę sąveiką tarp molekulinių būsenų, kaip esminį parametrą apibūdinantį pusiausvyrą. Ši sąveika nuo temperatūros priklauso priešingai, nei efektinė sąveika, apskaičiuota remiantis gerai žinoma poliarono transformacija, todėl mūsų darbas siūlo naują požiūrį į pusiausvyros problemas.
  2. A. Gelzinis, D. Abramavicius, L. Valkunas, Absorption lineshapes of molecular aggregates revisited, J. Chem. Phys. 142, 154107, 2015.
    Šiame darbe lyginome įvairius teorinius artinius, skirtus skaičiuoti molekulinių sistemų sugerties optines linijos formas. Parodėme, kad ctR teorija (angl. complex time-dependent Redfield) leidžia gauti pakankamai tikslius rezultatus su sąlyginai nedidelėmis skaičiavimo sąlygomis. Nors ši teorija buvo suformuluota anksčiau, iki mūsų ji niekada nebuvo naudota praktikoje.
  3. J. Chmeliov, A. Gelzinis, E. Songaila, R. Augulis, C. D. P. Duffy, A. V. Ruban, L. Valkunas, The nature of self-regulation in photosynthetic light-harvesting antenna, Nat. Plants 2, 16045, 2016.
    Šioje publikacijoje pristatyti pagrindinių augalų šviesorankos kompleksų (LHCII) agregatų laikinės skyros fluorescencijos matavimai, esant plačiam temperatūrų intervalui. Gautų rezultatų analizė ir modeliavimas parodė, kad spektruose esant žemoms temperatūroms išryškėjanti būsena, atsakinga už fluorescenciją ties ~ 700 nm, nėra susijusi su fluorescencijos gesimu. Už šį gesimą yra atsakinga tamsinė būsena, kurios mikroskopinę kilmę lemia nekoherentinė sužadinimo energijos pernaša iš chlorofilo į karotenoido molekules. Šie rezultatai paaiškina augaluose stebimo nefotocheminio fluorescencijos gesimo prigimtį.
  4. A. Gelzinis, D. Abramavicius, J. P. Ogilvie, L. Valkunas, Spectroscopic properties of photosystem II reaction center revisited, J. Chem. Phys. 147, 115102, 2017.
    Čia mes pasiūlėme antrosios fotosistemos reakcijų centro (FSII RC) stipriojo ryšio modelį, gebantį paaiškinti visą eilę spektroskopinių eksperimentų. Skaičiavimai atlikti su ctR teorija, kuri buvo praplėsta ir gautos išraiškos Štarko skirtuminės sugerties spektrų skaičiavimui. Mes parodėme, kad norint paaiškinti FSII RC Štarko spektroskopijos rezultatus, būtina į modelį įtraukti bent vieną krūvio pernašos būseną.
  5. A. Gelzinis, R. Augulis, V. Butkus, B. Robert, L. Valkunas, Two-dimensional spectroscopy for non-specialists, Biochim. Biophys. Acta 1860, 271-285, 2019.
    Šiame straipsnyje mes pateikiame dvimatės optinės spektroskopijos aprašymą, aptardami esmines sąvokas, principus, galimus taikymus ir tikėtinus rezultatus. Dauguma literatūroje randamų apžvalgų yra pertekę techninių detalių, o mūsų publikacija pateikia supaprastintą, bet dėl to visiems prieinamą, vaizdinį.

 

Visų mokslinių straipsnių sąrašas:

  1. Y. Braver, L. Valkunas, A. Gelzinis, Derivation of the stationary fluorescence spectrum formula for molecular systems from the perspective of quantum electrodynamics, Lith. J. Phys. 61, 110–13, 2021
  2. A. Devižis, A. Gelzinis, J. Chmeliov, M Diethelm, L. Endriukaitis, D. Padula, R. Hany, Carrier Tunneling from Charge Transfer States in Organic Photovoltaic Cells, Adv. Funct. Mater. 31, 2102000, 2021.
  3. A. Fakharuddin, M. Franckevičius, A. Devižis, A. Gelžinis, J. Chmeliov, P. Heremens, V. Gulbinas, Double Charge Transfer Dominates in Carrier Localization in Low Bandgap Sites of Heterogeneous Lead Halide Perovskites, Adv. Funct. Mater. 31, 2010076, 2021.
  4. A. Gelzinis, R. Augulis, C. Büchell, B. Robert, L. Valkunas, Confronting FCP structure with ultrafast spectroscopy data: evidence for structural variations, Phys. Chem. Chem. Phys. 23, 806-821, 2021.
  5. V. Mascoli, A. Gelzinis, J. Chmeliov, L. Valkunas, R. Croce, Light-harvesting complexes access analogue emissive states in different environments, Chem. Sci. 11, 5697–5709, 2020.
  6. Y. Braver, L. Valkunas, A. Gelzinis, Benchmarking the forward–backward trajectory solution of the quantum-classical Liouville equation, J. Chem. Phys. 152, 214116, 2020.
  7. A. Gelzinis, L. Valkunas, Analytical derivation of equilibrium state for open quantum system, J. Chem. Phys. 152, 051103, 2020.
  8. J. Chmeliov, A. Gelzinis, M. Franckevičius, M. Tutkus, F. Saccon, A. V. Ruban, L. Valkunas, Aggregation-Related Nonphotochemical Quenching in the Photosynthetic Membrane, J. Phys. Chem. Lett. 10, 7340–7346.
  9. Y. Braver, A. Gelzinis, J. Chmeliov, L. Valkunas, Application of decay- and evolution-associated spectra for molecular systems with spectral shifts or inherent inhomogeneities, Chem. Phys. 525, 110403, 2019.
  10. A. Gelzinis, R. Augulis, V. Butkus, B. Robert, L. Valkunas, Two-dimensional spectroscopy for non-specialists, Biochim. Biophys. Acta 1860, 271-285, 2019.
  11. A. Gelzinis, Y. Braver, J. Chmeliov, L. Valkunas, Decay- and evolution-associated spectra of time-resolved fluorescence of LHCII aggregates, Lith. J. Phys. 58, 295-306, 2018.
  12. E. Rybakovas, A. Gelzinis, L. Valkunas, Simulations of absorption and fluorescence lineshapes using the reaction coordinate method, Chem. Phys. 515, 242–251, 2018.
  13. A. Gelzinis, J. Chmeliov, A. V. Ruban, L. Valkunas, Can red-emitting state be responsible for fluorescence quenching in LHCII aggregates?, Phot. Res. 135, 275–284, 2018.
  14. A. Gelzinis, E. Rybakovas, L. Valkunas, Applicability of transfer tensor method for open quantum system dynamics, J. Chem. Phys. 147, 234108, 2017.
  15. A. Gelzinis, D. Abramavicius, J. P. Ogilvie, L. Valkunas, Spectroscopic properties of photosystem II reaction center revisited, J. Chem. Phys. 147, 115102, 2017.
  16. J. Pan, A. Gelzinis, V. Chorošajev, M. Vengris, S. Seckin Senlik, J.-R. Shen, L. Valkunas, D. Abramavicius, J. P. Ogilivie, Ultrafast energy transfer within the photosystem II core complex, Phys. Chem. Chem. Phys. 19, 15356-15367, 2017.
  17. V. Chorošajev, A. Gelzinis, L. Valkunas, D. Abramavicius, Benchmarking the stochastic time-dependent variational approach for excitation dynamics in molecular aggregates, Chem. Phys. 481, 108-116, 2016.
  18. J. Chmeliov, A. Gelzinis, E. Songaila, R. Augulis, C. D. P. Duffy, A. V. Ruban, L. Valkunas, The nature of self-regulation in photosynthetic light-harvesting antenna, Nat. Plants 2, 16045, 2016.
  19. A. Gelzinis, D. Abramavicius, L. Valkunas, Absorption lineshapes of molecular aggregates revisited, J. Chem. Phys. 142, 154107, 2015.
  20. V. Butkus, A. Gelzinis, R. Augulis, A. Gall, C. Büchell, B. Robert, D. Zigmantas, L. Valkunas, D. Abramavicius, Coherence and population dynamics of chlorophyll excitations in FCP complex: Two-dimensional spectroscopy study, J. Chem. Phys. 142, 212414, 2015.
  21. A. Gelzinis, V. Butkus, E. Songaila, R. Augulis, A. Gall, C. Büchell, B. Robert, D. Abramavicius, D. Zigmantas, L. Valkunas, Mapping energy transfer channels in fucoxanthin-chlorophyll protein complex, Biochim. Biophys. Acta 1847, 241-247, 2015.
  22. F. D. Fuller, J. Pan, A. Gelzinis, V. Butkus, S. S. Senlik, D. E. Wilcox, C. F. Yocum, L. Valkunas, D. Abramavicius, J. P. Ogilvie, Vibronic coherence in oxygenic photosynthesis, Nat. Chem. 6, 706-711, 2014.
  23. V. Chorošajev, A. Gelzinis, L. Valkunas, D. Abramavicius, Dynamics of exciton-polaron transition in molecular assemblies: The variational approach, J. Chem. Phys. 140, 244108, 2014.
  24. E. Songaila, R. Augulis, A. Gelzinis, V. Butkus, A. Gall, C. Büchell, B. Robert, D. Zigmantas, D. Abramavicius, L. Valkunas, Ultrafast Energy Transfer from Chlorophyll c2 to Chlorophyll a in Fucoxanthin-Chlorophyll Protein Complex, J. Phys. Chem. Lett. 4, 3590-3595, 2013.
  25. A. Gelzinis, L. Valkunas, F. D. Fuller, J. P. Ogilvie, S. Mukamel, D. Abramavicius, Tight-binding model of the photosystem II reaction center: application to two-dimensional electronic spectroscopy, New J. Phys. 15, 075013, 2013.
  26. V. Balevičius Jr., A. Gelzinis, D. Abramavicius, L. Valkunas, Excitation Energy Transfer and Quenching in a Heterodimer: Applications to the Carotenoid-Phthalocyanine Dyads, J. Phys. Chem. B 117, 11031-11041, 2013.
  27. V. Balevičius Jr., A. Gelzinis, D. Abramavicius, T. Mančal, L. Valkunas, Excitation dynamics and relaxation in a molecular heterodimer, Chem. Phys. 404, 94-102, 2012.
  28. A. Gelzinis, D. Abramavicius, L. Valkunas, Non-Markovian effects in time-resolved fluorescence spectrum of molecular aggregates: tracing polaron formation, Phys. Rev. B 84, 245430, 2011.
  29. V. Butkus, A. Gelzinis, L. Valkunas, Quantum coherence and disorder-specific effects in simulations of 2D spectra of one-dimensional J-aggregates, J. Phys. Chem. A 115, 3876-3885, 2011.
  30. V. Butkus, D. Abramavicius, A. Gelzinis, L Valkunas, Two-dimensional optical spectroscopy of molecular aggregates, Lith. J. Phys. 50, 267-303, 2010.